Jedinica se često smješta u zasebnu sobu/prostor za pripremu pufera (područje čiste sobe 1). Za ovaj sustav, izazovi su vrijeme miješanja praha i filtriranje čestica u vreću za pohranu. Pufer može imati definirani pH i vrijednost vodljivosti. Pufer se priprema s različitim komponentama koje mogu imati nisku topljivost ili visoku viskoznost. Komponente pufera mogu se dodati u krutom obliku (dodavanje praha putem antistatičkih vreća) ili tekućine (putem 2D vreća i titracijske linije). Podešavanje ovisi o jačini pufera, jačini kiseline/baze, volumenu i promjeru titracijske linije. Stoga se preporučuju scale-down ispitivanja.